Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms