Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clstn2Q9ER65 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn2Q9ER65 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms