Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef4Q9EQZ6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms