Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SgshQ9EQ08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SgshQ9EQ08 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms