Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ropn1lQ9EQ00 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1lQ9EQ00 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms