Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r172Q9EPS4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms