Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rpgrip1Q9EPQ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms