Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3fQ9DCH4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms