Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp4Q9DBY0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp4Q9DBY0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms