Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem43Q9DBS1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem43Q9DBS1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms