Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ftsj3Q9DBE9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms