Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tysnd1Q9DBA6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tysnd1Q9DBA6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms