Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fundc1Q9DB70 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms