Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms