Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim23Q9DAL0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms