Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms