Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2al1mQ9DAD9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms