Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc89Q9DA73 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms