Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efhc1Q9D9T8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms