Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Speer4bQ9D9F7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Speer4bQ9D9F7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms