Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc70Q9D9B0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc70Q9D9B0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms