Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1qtnf2Q9D8U4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1qtnf2Q9D8U4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms