Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SlirpQ9D8T7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms