Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl4Q9D8E6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms