Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4bQ9D8B3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp4bQ9D8B3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp4bQ9D8B3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms