Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Cldn22Q9D7U6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn22Q9D7U6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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