Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmem54Q9D7S1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tmem54Q9D7S1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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