Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Capns2Q9D7J7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Capns2Q9D7J7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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