Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa5Q9D7I0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa5Q9D7I0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms