Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpap3Q9D706 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpap3Q9D706 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpap3Q9D706 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rpap3Q9D706 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms