Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc94Q9D6J3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc94Q9D6J3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms