Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb4aQ9D6F9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb4aQ9D6F9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms