Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PudpQ9D5U5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PudpQ9D5U5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms