Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Lpcat2bQ9D5U0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lpcat2bQ9D5U0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lpcat2bQ9D5U0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lpcat2bQ9D5U0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms