Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f1Q9D5Q6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f1Q9D5Q6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms