Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3a3Q9D554 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms