Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lonrf3Q9D4H7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lonrf3Q9D4H7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms