Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clvs1Q9D4C9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms