Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus10Q9D3U0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pus10Q9D3U0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms