Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx20Q9D2Y5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms