Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnaaf1Q9D2H9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms