Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Batf3Q9D275 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms