Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MrnipQ9D1F5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms