Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syf2Q9D198 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syf2Q9D198 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms