Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hddc3Q9D114 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc3Q9D114 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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