Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T7

Gkn3, Gastrokine-3, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn3Q9D0T7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn3Q9D0T7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn3Q9D0T7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms