Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Zbed3Q9D0L1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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Zbed3Q9D0L1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Zbed3Q9D0L1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Zbed3Q9D0L1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Zbed3Q9D0L1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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Zbed3Q9D0L1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbed3Q9D0L1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbed3Q9D0L1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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