Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spc24Q9D083 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spc24Q9D083 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms