Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3bQ9CZT8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms