Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nde1Q9CZA6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms